中国-东盟农业科技创新联盟经由广西农业科学院倡议发起,涉农科研机构、高校和企业自愿结成,共同创建;并于2018年9月第二届中国-东盟农业科技交流合作研讨会上正式成立。该联盟致力于推进中国和东盟国家农业科技交流、合作和创新,是农业领域多边交流的全新合作平台。在联盟成立仪式上,34家国内单位和14家国外单位签名加入。联盟秘书处常设于广西农业科学院国际合作处。秘书处负责联盟日常工作,同时也是联盟成员之间的沟通媒介。