Tropical Plants《热带植物》是由海南大学创办的国际英文期刊,这是海南大学第一本国际期刊,也是国内第一本关注热带植物的国际期刊。5月22日,广西南亚所自主选育的优良品种“桂热1号”挂果图入选第一期刊封面,我所担纲通讯作者的研究论文“Chromosomal-level genome of macadamia (Macadamia integrifolia)”以封面文章形式正式在该期刊上线发表。
“Chromosomal-level genome of macadamia (Macadamia integrifolia)”(澳洲坚果染色体水平基因组)研究论文,是广西南亚所澳洲坚果研究团队与海南大学联合攻关“澳洲坚果基因组及果仁营养物代谢研究”的最新研究成果,我所研究员王文林为该论文的通讯作者,高级农艺师谭秋锦为论文的参与作者。该研究主要利用nanopore测序法对高度杂合的澳洲坚果优良品种“桂热1号”的基因组进行了测序和组装,获得了807 Mb的基因组(contig N50,1.9 Mb;scaffold N50,54.70 Mb)和14条染色体,同时对基因注释和同源蛋白进行比较,获得453 Mb(约55.95%)重复序列和37657个蛋白质编码基因。通过染色体水平基因组的分析,从中了解到约11537万年前山龙眼科从莲科演化而来,约1.4亿年前从茜草科演化而来。该研究首次发现了澳洲坚果染色水平基因组,为澳洲坚果新品种培育和分子机制研究提供了材料和理论支撑。
澳洲坚果“桂热1号”挂果图
澳洲坚果基因组
南亚所 谭秋锦供稿/供图 王文林审核