亚热带果蔬安全控制重点实验室（以下简称“重点实验室”）主要从事亚热带果品蔬菜等农产品质量安全控制基础研究和应用基础研究，为广西壮族自治区亚热带作物研究所的大型仪器共享平台。现有省部级研究平台3个：农业农村部亚热带果品蔬菜质量安全控制重点实验室（2022年试运行）、广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室（2023年认定）和广西壮族自治区芒果产业绿色高效发展工程研究中心（2022年认定）。

重点实验室以产业实际问题为导向，紧紧围绕亚热带果品蔬菜的品种选育、生产种植、加工和贮存运输等全链条过程，针对制约亚热带果品蔬菜行业发展的关键技术难题开展科学研究，切实保证亚热带果品蔬菜的质量安全，加快推进基础研究转化和科研成果产业化。主要研究方向为以芒果为代表的亚热带果蔬种质资源搜集、鉴定及评价；优良新品种培育与绿色高效栽培；构建亚热带主要果蔬污染物防控及安全生产技术体系；构建适用于我国亚热带果蔬农药残留的风险评估模型并开展相应的评估；建立亚热带果蔬品质与营养数据库、产品活性物质及营养功能分析评价技术平台。

重点实验室现有科研用房面积1800 m2，科研仪器设备先进完善，配备液相色谱-四级杆串联飞行时间质谱、液相色谱-质谱仪、气相色谱、原子吸收分光光度计等仪器设备约154台（套），设备固定资产1700余万元；内设有分子生物学实验室、植物生理生化实验室、植物气候培养室、植物病理室等。

重点实验室固定管理及科研人员14人，其中正高级职称2人，副高级职称5人，博士3人，专业领域涵盖了植物学、作物学、生物化学与分子生物学、资源利用与植物保护、植物生理与生物化学等。