国家水稻改良中心南宁分中心于2004年8月获农业部批准建设，建设单位为广西农业科学院水稻研究所。该分中心于2007年11月竣工并投入使用，2011年5月获农业部批复进行二期建设。分中心现拥有实验室2500平方米，种子冷藏室800平方米，种子加工车间401.52平方米，仪器设备120台套，此外，还拥有温室、晒场、防虫（鸟）网室、引种隔离实验圃、野生稻圃等配套设施。分中心主要开展以下研究：1.稻种资源的收集、鉴定和创新利用；2.高产优质多抗水稻新品种选育及原种繁殖；3.水稻高产高效可持续发展的栽培技术研究；4.水稻生理研究等；5.分子育种与转基因育种研究。据统计，自2008年分中心获批建设以来，分中心共育成水稻新品种49个，获得各级成果奖35项，其中“华南杂交水稻优质化育种创新及新品种选育”项目获国家科技进步二等奖，“杂交水稻优质化育种创新及新品种选育”项目获广西科学技术特别贡献奖。
